مراسم تشییع پیکر مطهر او از میدان اصلی شهرری آغاز و به سمت آستان مقدس حضرت عبدالعظیم حسنی(ع) ادامه پیدا کرد. پس از اقامه نماز بر پیکر مطهر، برای انجام خاکسپاری او را به قطعه 50 گلزار شهدای تهران در بهشت زهرا(س) منتقل کردند. شهید محمد مهدی صابری در جوار همرزمان شهیدش به خاک سپرده شد.
شهید محمد مهدی صابری در حلب سوریه سال 94 به شهادت رسید اما پیکر او مفقود و در شمار شهدای مفقودالاثر قرار گرفت. پیکر مطهر این شهید بزرگوار پس از سه سال به کشور بازگشته و به خاک سپرده شد.